Хаплогрупа М18
Хаплогрупа М18 — човечка митохондријална ДНК (mtДНК) хаплогрупа. Тоа е лоза специфична за Индија.[1][2][3]
Хаплогрупа M18 | |
---|---|
Можно време на потекло | 17,100 ± 4,700 п.н.е.,[1] и 20,800 ± 8,900 п.н.е.[2] |
Можно место на потекло | Индија |
Предок | M4'30 |
Својствени мутации | 12498, 15942, 194 |
Потекло
уредиМ18 е потомок на макро-хаплогрупата[3] (mtДНК) и[1] индиска специфична варијанта на М. хаплогрупи од коренот на хаплогрупата М (суперхаплогрупа М4'30).[2][3][4] Супер-клад M4'30 е единствениот клад што дели средна лоза помеѓу 2 хаплогрупи, додека остатокот од сите M лоза потекнува независно од коренот на макрохаплогрупата М; со што се поддржува идејата за брзо растурање на современите луѓе долж азискиот брег откако тие ја напуштиле Африка, проследено со долг период на изолација.[3]
Во очекување на дополнителни информации од комплетните mtДНК секвенци, хаплогрупата M18 првпат беше дефинирана од Метспалу и сор., во 2004 година со користење на трансверзијата на np 16318.[1] Ова подоцна беше ревидирано од Тангарај и сор., во 2006 година.[2] Во моментов, хаплогрупата се карактеризира со две мутации на кодирачкиот регион, 12498 и 15942, и дополнителна мутација на контролниот регион 194.[2]
Распространетост
уредиСтудијата од 2004 година на Метспалу и сор., ја анализираше варијацијата на mtДНК кај примероците од 796 Индијци, 436 Иранци и ги спореди со примероци од Европа, Кина и Тајланд. Студијата покажа преваленца на М18 на ниски честоти низ широка географска област која ги опфаќа југоисточните делови на Саудиска Арабија, широко низ Иран, Пакистан, Индија, Непал, Бангладеш и Мјанмар.[1]
Студијата на Метспалу откри дека просторната дистрибуција на М18 достигнала врв низ дел од Пенџаб Пакистан, Пенџаб, Индија, Раџастан и низ голем дел од Андра Прадеш.[5]
Високата инциденца (33%) на јазолскиот хаплотип M18 кај Лода од Западен Бенгал што зборува австроазија, сугерираше можен основачки ефект кај оваа популација.[1] Исто така, ја објасни речиси двократната разлика помеѓу проценките за спојување за овој кластер пресметани со и без племенските податоци, во студијата на Метспалу.[1]
Бидејќи интензивниот генетски дрифт (особено ефектите на основачот) може да воведе пристрасност во пресметката на времето на спојување, затоа Метспалу и сор. 17.100 ± 4.700 п.н.е. соодветно.[1] Тангарај и сор., ја процениле возраста на спојување на Хаплогрупата М18 на 20,800 ± 8900 ybp (Тангарај и сор., 2006).[2]
Сумирајќи, поединци од Хаплогрупата М18 се пронајдени во
- Саудиска Арабија
- Иран
- Авганистан
- Пакистан
- Индија
- Непал
- Бутан
- Кина
- Бангладеш
- Мјанмар
Дополнително, Хаплоггрупата М18а е пронајдена во мезолитски ловец-собирач во близина на Балангода, Шри Ланка датиран cal BP 5455-5375.[6]
Распространетост во Индија
уредиРелативно висока честота на хаплогрупата М18 беше забележана во Пардхан од Андра Прадеш, додека таа беше целосно отсутна во Најкпод Гонд и Анд (Тангарај и сор., 2006).[2] M18 беше пронајден во Браманите од Утар Прадеш (Сан и сор., 2006), Десаст Браман од Махараштра (Гаиквад и Кашјап, 2005 година), Кандајат од Ориса (Саху и Кашјап, 2006 година) и Ораон од Бихар ал (2006, Тангарај).[2]
Чандрасекар А и Рагавендра Рао, и сор., го потврдија монофилетското потекло на Хаплогрупата М18 и открија дека се јавува со висока честота кај луѓето од Мал Пахарија (со 29% од големината на примерокот).[7]
Студијата на Метспалу и сор., откри дека хаплогрупата М18 низ Андра Прадеш и југоисточниот дел на Тамил Наду, но целосно отсутна во соседните Карнатака и Керала. Можно објаснување е олеснувањето на мешањето долж крајбрежјето на Арапското Море и Бенгалскиот Залив.[1] Меѓутоа, бидејќи апсолутната честота на оваа хаплогрупа е прилично мала, не може да се исклучи дека зголемувањето на големината на примерокот би го нарушило набљудуваниот модел на ширење.[1]
Наводи
уреди- ↑ 1,00 1,01 1,02 1,03 1,04 1,05 1,06 1,07 1,08 1,09 Metspalu, Mait; Kivisild, Toomas; Metspalu, Ene; Parik, Jüri; Hudjashov, Georgi; Kaldma, Katrin; Serk, Piia; Karmin, Monika; Behar, Doron M (2004). „Most of the extant mtDNA boundaries in South and Southwest Asia were likely shaped during the initial settlement of Eurasia by anatomically modern humans“. BMC Genetics. 5: 26. doi:10.1186/1471-2156-5-26. PMC 516768. PMID 15339343. Грешка во наводот: Неважечка ознака
<ref>
; називот „metspalu2004“ е зададен повеќепати со различна содржина. - ↑ 2,0 2,1 2,2 2,3 2,4 2,5 2,6 2,7 Maji, S; Krithika, S; Vasulu, TS (April 2009). „Phylogeographic distribution of mitochondrial DNA macrohaplogroup M in India“. Journal of Genetics. 88 (1): 127–39. doi:10.1007/s12041-009-0020-3. PMID 19417557. Грешка во наводот: Неважечка ознака
<ref>
; називот „maji2009“ е зададен повеќепати со различна содржина. - ↑ 3,0 3,1 3,2 3,3 Thangaraj, Kumarasamy; Chaubey, Gyaneshwer; Singh, Vijay; Vanniarajan, Ayyasamy; Thanseem, Ismail; Reddy, Alla G; Singh, Lalji (2006). „In situ origin of deep rooting lineages of mitochondrial Macrohaplogroup 'M' in India“. BMC Genomics. 7: 151. doi:10.1186/1471-2164-7-151. PMC 1534032. PMID 16776823. Грешка во наводот: Неважечка ознака
<ref>
; називот „pmid16776823“ е зададен повеќепати со различна содржина. - ↑ Sun, Chang; Kong, Qing-Peng; Palanichamy, Malliya gounder; Agrawal, Suraksha; Bandelt, Hans-Jürgen; Yao, Yong-Gang; Khan, Faisal; Zhu, Chun-Ling; и др. (2005). „The Dazzling Array of Basal Branches in the mtDNA Macrohaplogroup M from India as Inferred from Complete Genomes“. Molecular Biology and Evolution. 23 (3): 683–90. doi:10.1093/molbev/msj078. PMID 16361303.
- ↑ Metspalu, Mait; Kivisild, Toomas; Metspalu, Ene; Parik, Jüri; Hudjashov, Georgi; Kaldma, Katrin; Serk, Piia; Karmin, Monika; Behar, Doron M (2004). „Most of the extant mtDNA boundaries in south and southwest Asia were likely shaped during the initial settlement of Eurasia by anatomically modern humans“. BMC Genetics. 5 (1): 26. doi:10.1186/1471-2156-5-26. PMC 516768. PMID 15339343.
- ↑ Fernando, A. S.; Wanninayaka, A.; Dewage, D.; Karunanayake, E. H.; Rai, N.; Somadeva, R.; Tennekoon, K. H.; Ranasinghe, R. (February 2023). „The mitochondrial genomes of two Pre-historic Hunter Gatherers in Sri Lanka“. Journal of Human Genetics. 68 (2): 103–105. doi:10.1038/s10038-022-01099-w. PMID 36450887 Проверете ја вредноста
|pmid=
(help). - ↑ A, Chandrasekar; al., et; Sreenath, Jwalapuram; Sarkar, Bishwa Nath; Urade, Bhaskar Pralhad; Mallick, Sujit; Bandopadhyay, Syam Sundar; Barua, Pinuma; Barik, Subihra Sankar (2009). „Updating Phylogeny of Mitochondrial DNA Macrohaplogroup M in India: Dispersal of Modern Human in South Asian Corridor“. PLOS ONE. 4 (10): e7447. Bibcode:2009PLoSO...4.7447C. doi:10.1371/journal.pone.0007447. PMC 2757894. PMID 19823670.