Хаплогрупа S-M230
Хаплогрупата S-M230, позната и како S1a1b (а претходно како S* или K2b1a4), е хоплогрупа на ДНК на човечки Y-хромозомот. Тоа е далеку од нумерички најзначајната подклада на Хаплоггрупата S1a (и нејзината единствена примарна подклада, Хаплогрупата S-P405).
Хаплогрупа S-M230 (S1a1b) | |
---|---|
Податотека:Меланезија S AND-Y.PNG | |
Можно време на потекло | 28,000-41,000 години пред сегашноста Предлошка:Харв |
Можно место на потекло | Нова Гвинеја/Индонезија |
Предок | S1a1 (Z42413)[1][2] |
Потомци | S1a1b1 (M254) |
Својствени мутации | M230, P202 |
Најголеми честоти | Екари 74% Предлошка:Харв |
S-M230 најчесто се наоѓа меѓу популациите на висорамнините на Папуа Нова Гвинеја (Kayjser 2003). Забележан е и со пониск и на пониски честоти во соседните делови на Индонезија и Меланезија.[1] ( Kayser 2003 Cox 2006 )
Потекло
уредиРаспространетост
уредиЕдна студија објавила дека е пронајдена хаплогрупата S-M230 во: 52% (16/31) од примерокот од висорамнините на Папуа Нова Гвинеја (PNG); 21% (7/34) од примерокот од Молуките; 16% (5/31) од примерокот од брегот на Папуа Нова Гвинеја; 12,5% (2/16) од примерокот на Толаи од Нова Британија; 10% (3/31) од примерокот од Мали Сундски Острови и; 2% (2/89) од примерокот од низините/брегот на Западна Нова Гвинеја. ( Kayser 2003 Cox 2006 )
Една подклада, Хаплогрупата S-M226.1 (S1a1b1d1a; претходно S1d) е пронајдена на ниски честоти на Адмиралитетите и долж брегот на копното PNG. Kayser 2008 .
Филогенетика
уредиСтруктура и позиција во рамките на Хаплогрупата С
уреди- S1a
- S1a1 Z42413
- S1a1a
- S1a1a1 P60, P304, P308
- S1a1a2
- S1a1b M230, P202, P204 – „симнат“ во 2016 година од претходната позиција како базална Хаплогрупа S* (а претходно позната како Хаплогрупа К5)
- S1a1b1 (M254) (претходно познат како K2b1a4a)
- S1a1b1 (M254)
- S1a1b1a (P57)
- S1a1b1b (P61)
- S1a1b1c (P83)
- S1a1b1d (SK1891)
- S1a1a
- S1a2 P79, P307
- S1a3 P315
- S1a3a Z41763
- S1a3b~ P401
- (Врз основа на дрвото ISOGG од 2017 година,[1] дрвото ISOGG од 2015 година,[3] ) дрвото на МКЦ од 2008 година Karafet 2008 и други објавени истражувања.)
Историја
уредиПред 2002 година, во академската литература имало најмалку седум системи за именување на филогенетското дрво на Y-хромозомот. Ова довело до значителна конфузија. Во 2002 година, главните истражувачки групи се собрале и го формиралеконзорциумот на Y-хромозомот (YCC) . Тие објавиле заеднички труд кој создал единствено ново дрво кое сите се согласиле да го користат. Подоцна, група граѓански научници со интерес за популациската генетика и генетската генеалогија формирале работна група за да се создаде аматерско дрво со цел да биде пред сè навремено. Табелата подолу ги обединува сите овие дела на местото на обележјето на МКЦ дрвото од 2002 година. Ова му овозможува на истражувачот што прегледува постара објавена литература брзо да се движи помеѓу номенклатурите.
YCC 2002/2008 (стенограф) | (α) | (β) | (γ) | (δ) | (ε) | (ζ) | (η) | YCC 2002 година (Лонгханд) | YCC 2005 година (Лонгханда) | YCC 2008 година (Лонгханд) | YCC 2010r (Лонгханд) | ISOGG 2006 година | ISOGG 2007 година | ISOGG 2008 година | ISOGG 2009 година | ISOGG 2010 година | ISOGG 2011 година | ISOGG 2012 година |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
К-М9 | 26 | VIII | 1U | 25 | ЕУ16 | Н5 | Ф | К* | К | К | К | - | - | - | - | - | - | - |
Истражувачки публикации
уредиСледниве истражувачки тимови по нивните публикации биле претставени во креирањето на дрвото на YCC.
- α Џоблинг и Тајлер-Смит 2000 и Калаџиева 2001
- β Ундерхил 2000
- γ Хамер 2001
- δ Карафет 2001
- ε Семино 2000
- ζ Су 1999
- η Капели 2001
2005 YCC дрво
уреди- ↑ 1,0 1,1 1,2 International Society of Genetic Genealogy (ISOGG; 2017), Y-DNA Haplogroup Tree 2017 (24 March 2017).
- ↑ „Browse Articles | Европски весник за хумана генетика“. www.nature.com. Посетено на 25 Март 2023. Проверете ги датумските вредности во:
|accessdate=
(help) - ↑ International Society of Genetic Genealogy (ISOGG; 2015), Y-DNA Haplogroup Tree 2015. (Access date: 1 February 2015.)
2008 YCC дрво
уредиОд 2002 до 2008 година, таа била позната како Хаплогрупа К5 . [ Потребен е цитат ]
Поврзано
уредиГенетика
уреди- Генетска генеалогија
- Хаплогрупа
- Хаплотип
- Хаплогрупа на ДНК на човечки Y-хромозом
- Молекуларна филогенетика
- Парагрупа
- Потклад
- Хаплогрупи на Y-хромозом во популациите во светот
- Хаплогрупи на Y-DNA по етничка група
- Хаплогрупи на Y-ДНК во популации од Источна и Југоисточна Азија
Y-DNA S потклади
уреди- S-M230
Y-ДНК 'рбетот на филогенетското дрво
уредиНаводи
уредиЦитирани дела
уреди- Cox, Murray P.; Mirazón Lahr, Marta (2006). „Y-chromosome diversity is inversely associated with language affiliation in paired Austronesian- and Papuan-speaking communities from Solomon Islands“. American Journal of Human Biology. 18 (1): 35–50. doi:10.1002/ajhb.20459. PMID 16378340.
- Karafet, T. M.; Mendez, F. L.; Meilerman, M. B.; Underhill, P. A.; Zegura, S. L.; Hammer, M. F. (2008). „New binary polymorphisms reshape and increase resolution of the human Y chromosomal haplogroup tree“. Genome Research. 18 (5): 830–8. doi:10.1101/gr.7172008. PMC 2336805. PMID 18385274.
- Kayser, Manfred; Brauer, Silke; Weiss, Gunter; Schiefenhövel, Wulf; Underhill, Peter; Shen, Peidong; Oefner, Peter; Tommaseo-Ponzetta, Mila; Stoneking, Mark (2003). „Reduced Y-Chromosome, but Not Mitochondrial DNA, Diversity in Human Populations from West New Guinea“. The American Journal of Human Genetics. 72 (2): 281–302. doi:10.1086/346065. PMC 379223. PMID 12532283.
- Kayser, M.; Choi, Y.; Van Oven, M.; Mona, S.; Brauer, S.; Trent, R. J.; Suarkia, D.; Schiefenhovel, W.; Stoneking, M. (2008). „The Impact of the Austronesian Expansion: Evidence from mtDNA and Y Chromosome Diversity in the Admiralty Islands of Melanesia“. Molecular Biology and Evolution. 25 (7): 1362–74. doi:10.1093/molbev/msn078. PMID 18390477.
- Mona, S.; Tommaseo-Ponzetta, M.; Brauer, S.; Sudoyo, H.; Marzuki, S.; Kayser, M. (2007). „Patterns of Y-chromosome diversity intersect with the Trans-New Guinea hypothesis“. Mol. Biol. Evol. 24 (11): 2546–55. doi:10.1093/molbev/msm187. PMID 17846104.
- Scheinfeldt, L.; Friedlaender, F; Friedlaender, J; Latham, K; Koki, G; Karafet, T; Hammer, M; Lorenz, J (2006). „Unexpected NRY Chromosome Variation in Northern Island Melanesia“. Molecular Biology and Evolution. 23 (8): 1628–41. doi:10.1093/molbev/msl028. PMID 16754639.
Извори за табели за конверзија
уреди- Capelli, Cristian; Wilson, James F.; Richards, Martin; Stumpf, Michael P.H.; и др. (February 2001). „A Predominantly Indigenous Paternal Heritage for the Austronesian-Speaking Peoples of Insular Southeast Asia and Oceania“. The American Journal of Human Genetics. 68 (2): 432–443. doi:10.1086/318205. PMC 1235276. PMID 11170891.
- Hammer, Michael F.; Karafet, Tatiana M.; Redd, Alan J.; Jarjanazi, Hamdi; и др. (1 July 2001). „Hierarchical Patterns of Global Human Y-Chromosome Diversity“. Molecular Biology and Evolution. 18 (7): 1189–1203. doi:10.1093/oxfordjournals.molbev.a003906. PMID 11420360.
- Jobling, Mark A.; Tyler-Smith, Chris (2000), „New uses for new haplotypes“, Trends in Genetics, 16 (8): 356–62, doi:10.1016/S0168-9525(00)02057-6, PMID 10904265
- Kaladjieva, Luba; Calafell, Francesc; Jobling, Mark A; Angelicheva, Dora; и др. (February 2001). „Patterns of inter- and intra-group genetic diversity in the Vlax Roma as revealed by Y chromosome and mitochondrial DNA lineages“. European Journal of Human Genetics. 9 (2): 97–104. doi:10.1038/sj.ejhg.5200597. PMID 11313742.
- Karafet, Tatiana; Xu, Liping; Du, Ruofu; Wang, William; и др. (September 2001). „Paternal Population History of East Asia: Sources, Patterns, and Microevolutionary Processes“. The American Journal of Human Genetics. 69 (3): 615–628. doi:10.1086/323299. PMC 1235490. PMID 11481588.
- Semino, O.; Passarino, G; Oefner, PJ; Lin, AA; и др. (2000), „The Genetic Legacy of Paleolithic Homo sapiens sapiens in Extant Europeans: A Y Chromosome Perspective“, Science, 290 (5494): 1155–9, Bibcode:2000Sci...290.1155S, doi:10.1126/science.290.5494.1155, PMID 11073453
- Su, Bing; Xiao, Junhua; Underhill, Peter; Deka, Ranjan; и др. (December 1999). „Y-Chromosome Evidence for a Northward Migration of Modern Humans into Eastern Asia during the Last Ice Age“. The American Journal of Human Genetics. 65 (6): 1718–1724. doi:10.1086/302680. PMC 1288383. PMID 10577926.
- Underhill, Peter A.; Shen, Peidong; Lin, Alice A.; Jin, Li; и др. (November 2000). „Y chromosome sequence variation and the history of human populations“. Nature Genetics. 26 (3): 358–361. doi:10.1038/81685. PMID 11062480.
Поврзано
уреди- Haber, Marc; Platt, Daniel E.; Ashrafian Bonab, Maziar; Youhanna, Sonia C.; Soria-Hernanz, David F.; Martínez-Cruz, Begoña; Douaihy, Bouchra; Ghassibe-Sabbagh, Michella; и др. (2012). Kayser, Manfred (уред.). „Afghanistan's Ethnic Groups Share a Y-Chromosomal Heritage Structured by Historical Events“. PLOS ONE. 7 (3): e34288. Bibcode:2012PLoSO...734288H. doi:10.1371/journal.pone.0034288. PMC 3314501. PMID 22470552.
- Karafet, Tatiana M.; Lansing, J. S.; Redd, Alan J.; Watkins, Joseph C.; Surata, S. P. K.; Arthawiguna, W. A.; Mayer, Laura; Bamshad, Michael; и др. (2005). „Balinese Y-Chromosome Perspective on the Peopling of Indonesia: Genetic Contributions from Pre-Neolithic Hunter-Gatherers, Austronesian Farmers, and Indian Traders“. Human Biology. 77 (1): 93–114. doi:10.1353/hub.2005.0030. PMID 16114819.
|hdl-access=
бара|hdl=
(help) - Kayser, M.; Brauer, S; Cordaux, R; Casto, A; Lao, O; Zhivotovsky, LA; Moyse-Faurie, C; Rutledge, RB; и др. (2006). „Melanesian and Asian Origins of Polynesians: MtDNA and Y Chromosome Gradients Across the Pacific“. Molecular Biology and Evolution. 23 (11): 2234–44. doi:10.1093/molbev/msl093. PMID 16923821.
|hdl-access=
бара|hdl=
(help)