SH3 домен
SRC хомологен 3 домен (или скратено SH3 домен) е мал белковински (белковински) домен од околу 60 аминокиселински остатоци. Првично, SH3 бил опишан како сочувана низа во вирусниот адапторна белковина (анг. Signal transducing adaptor protein, STAP) v-Crk. Овој домен е исто така присутен во фосфолипазата и неколку цитоплазматски тирозински кинази, како што се Abl (Abelson murine leukemia viral oncogene homolog 1) и Src (Tyrosine-protein kinase CSK).[1][2] Исто така е идентификуван во неколку други белковински фамилии, како што се: PI3 киназа, Ras натсемејство GTPаза активирачка белковина, CDC24 и cdc25.[3][4][5] SH3 домените се наоѓаат во белковините на сигналните патишта кои го регулираат цитоскелетот, Ras белковината, Src киназата и многу други. SH3 белковините стапуваат во интеракција со адапторните белковини и тирозинските кинази. SH3 белковините обично се врзуваат далеку од активното место кога стапуваат во интеракција со тирозинските кинази. Во човечкиот геном има околу 300 SH3 домени. SH3 доменот е одговорен за контрола на замодејствата белковина-белковина во сигналните патишта[6] и регулација на интеракциите на белковините кои се вклучени во цитоплазматската сигнализација.[7]
| SH3 домен | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Лента дијаграм на SH3 домен, алфа спектрин, од кокошка (PDB код 1SHG), обоен од сино (N-терминал) до црвено (C-терминал). | |||||||||
| Назнаки | |||||||||
| Симбол | SH3_1 | ||||||||
| Pfam | PF00018 | ||||||||
| Pfam-клан | CL0010 | ||||||||
| InterPro | IPR001452 | ||||||||
| SMART | SM00326 | ||||||||
| PROSITE | PS50002 | ||||||||
| SCOP | 1shf | ||||||||
| SUPERFAMILY | 1shf | ||||||||
| CDD | cd00174 | ||||||||
| |||||||||
Структура
уредиSH3 доменот има карактеристичен склоп на бета цилиндар (анг. beta barrel), кој се состои од пет или шест β-нишки распоредени во две збиени антипаралелни β плочи. Линкер регионите може да содржат кратки завојници. Склопот на SH3 доменот е древен склоп, бидејќи се наоѓа и кај еукариотите и кај прокариотите.[8]
Белковини со SH3 домен
уреди- Адапторни белковини за пренесување на сигнали
- CDC24
- Cdc25
- PI3 киназа
- Фосфолипаза
- Ras GTPаза активирачка белковина
- Vav прото-онкоген
- GRB2
- p54 S6 киназа 2 (S6K2)
- SH3D21
- C10orf76 (веројатно)
- STAC3
- Некои миозини
- SHANK1,2,3
- ARHGAP12
- C8orf46
- TANGO1
- Интеграза
- Фокална адхезиона киназа (FAK, PTK2)
- Тирозинска киназа богата со пролин (Pyk2, CADTK, PTK2beta)
- TRIP10 (cip4)
Поврзано
уредиНаводи
уреди- ↑ „SH2 and SH3 domains“. Current Biology. 3 (7): 434–42. July 1993. doi:10.1016/0960-9822(93)90350-W. PMID 15335710.
- ↑ „SH3 domains: complexity in moderation“. Journal of Cell Science. 114 (Pt 7): 1253–63. April 2001. PMID 11256992.
- ↑ „SH3--an abundant protein domain in search of a function“. FEBS Letters. 307 (1): 55–61. July 1992. doi:10.1016/0014-5793(92)80901-R. PMID 1639195.
- ↑ „Signalling through SH2 and SH3 domains“. Trends in Cell Biology. 3 (1): 8–13. January 1993. doi:10.1016/0962-8924(93)90194-6. PMID 14731533.
- ↑ „Protein modules and signalling networks“. Nature. 373 (6515): 573–80. February 1995. doi:10.1038/373573a0. PMID 7531822.
- ↑ „SH2/SH3 signaling proteins“. Current Opinion in Genetics & Development. 4 (1): 25–30. February 1994. doi:10.1016/0959-437X(94)90087-6. PMID 8193536.
- ↑ „SH2 and SH3 domains: elements that control interactions of cytoplasmic signaling proteins“. Science. 252 (5006): 668–74. May 1991. PMID 1708916.
- ↑ „SH3 domains in prokaryotes“. Trends in Biochemical Sciences. 24 (4): 132–3. April 1999. doi:10.1016/s0968-0004(99)01366-3. PMID 10322416.
Надворешни врски
уреди- Nash Lab домени кои стапуваат во интеракција со белковини во тек на преносот на сигнали - SH3 доменот[мртва врска] (англиски)
- GENEART Архивирано на 7 јули 2009 г. (англиски)