DrugBank: Разлика помеѓу преработките

[проверена преработка][проверена преработка]
Избришана содржина Додадена содржина
с →‎Историја на верзиите: Правописна исправка, replaced: прв пат → првпат using AWB
Нема опис на уредувањето
Ред 1:
{{Infobox biodatabase|title=DrugBank|logo=[[File:Drugbank logo.svg|frameless]]|description=база на податоци (лекови/дрога)|scope=Хемиски структури, лекови за мали молекули, биотехнолошки лекови, цели на лекови, транспортери на лекови, низа на наркотични лекови, СНП на лекови, метаболити на лекови, описи на лекови, здруженија на болести, дозирни податоци, интеракции со храна и лекови, несакани реакции на лекови, фармакологија, механизми на дејствување , метаболизам на лекови, хемиска синтеза, податоци за патенти и цени, хемиски својства, номенклатура, синоними, хемиска таксономија, спектар на лекови NMR, спектар на лекови GC-MS, спектар на лекови LC-MS|center=Универзитетот Алберта|laboratory=Доктор Давид Висхарт|citation=DrugBank: a comprehensive resource for in silico drug discovery and exploration.<ref name="pmid16381955">{{cite journal |title=DrugBank: a comprehensive resource for in silico drug discovery and exploration|last=Wishart|first=DS|author2=Knox C |author3=Guo AC |journal=Nucleic Acids Research|date=Jan 2006|volume=34|issue=Database issue|page=D668-D672|doi=10.1093/nar/gkj067|pmid=16381955 |pmc=1347430|display-authors=etal}}</ref>|released=|url={{URL|www.drugbank.ca}}|download={{URL|www.drugbank.ca/downloads}}}}
'''Базата на''' податоци „ '''DrugBank“DrugBank''' е сеопфатна, слободно достапна, интернет база на податоци што содржи информации за [[Дрога|лекови]] и цели на одредени [[Дрога|лекови]]. Исто како биоинформатичките и [[Хеминформатика|хеминформатичките]] ресурси, DrugBank комбинира податоци за детална лекови (односно хемискa, фармаколошкa и фармацевтскa) со сеопфатна цел на лековита (т.е. низа, структура и пат на крвоток) и информации за нејзината улога. DrugBank користела содржина од [[Википедија]] . Википедија, исто така, честопати се поврзува со DrugBank.
 
Најновото издание на базата на податоци (верзија 5.0) содржи 9591 записи за лекови вклучувајки 2037 ситно-молекуларни лекови одобрени од ФДА, 241лекови одобрени од ФДА кои се биотехнички (протеини / пептидни) , 96 нутриционистички лекови и над 6000 експериментални лекови. Покрај тоа, 4270 секвенци кои не се редундантни протеини (т.е. целни / ензими / транспортерни / носителни) секвенци се поврзани со овие записи на лекови. Секој запис на DrugCard содржи повеќе од 200 полиња со податоци со половина од информациите кои се посветени на податоците за лекови / хемикалии, а другата половина посветена на податоците за целта на лекот или податоци за протеините.
 
Четири дополнителни бази на податоци, HMDB, T3DB, SMPDB и FooDB се исто така дел од генералниот опфат на метаболички/[[Хеминформатика|хеминиформатски]] бази на податоци. HMDB содржи еквивалентни информации за повеќе од 40 000 човечки метаболити, T3DB содржи информации за 3100 вообичаени токсини и загадувачи на животната средина, SMPDB содржи дијаграми на патеки за скоро 700 човечки метаболички патеки и патеки на болести, додека FooDB содржи еквивалентни информации за 28,000 компоненти за [[Прехранбени адитиви|храна и додатоци на храна]] .
 
== Историја на верзиите ==
Првата верзија на DrugBank беше објавена во 2006 година. Оваа рана објавена верзија содржеше релативно скромни информации за 841 ситно молекуларни лекови одобрени од ФДА и 113 биотехнолошки лекови. Исто така, вклучуваше 2133 информации за цели на лекови . Втората верзија на DrugBank беше објавена во 2009 година.<ref name="pmid18048412">{{Наведено списание|last=Wishart|first=DS|last2=Knox C|last3=Guo AC|displayauthors=etal|date=Jan 2008|title=DrugBank: a knowledgebase for drugs, drug actions and drug targets|journal=Nucleic Acids Research|volume=36|issue=Database issue|page=D901–906|doi=10.1093/nar/gkm958|pmc=2238889|pmid=18048412}}</ref> Оваа значително била проширена и подобрена верзија на базата на податоци која опфаќала 1344 одобрени лекови за ситни молекули и 123 лекови за биотехника, како и 3037 уникатни цели на лековите. Верзијата 2.0 исто така, за првпат вклучуваше повлечени лекови и [[Трговија со дрога|недозволена лекови]], широките интеракции на храна-лекови и лекови-лекови, како и параметрите ADMET (апсорпција, дистрибуција, метаболизам, екскреција и токсичност). Верзијата 3.0 беше објавена во 2011 година.<ref name="pmid21059682">{{Наведено списание|last=Knox|first=C|last2=Law, V|last3=Jewison, T|last4=Liu, P|last5=Ly, S|last6=Frolkis, A|last7=Pon, A|last8=Banco, K|last9=Mak, C|date=Jan 2011|title=DrugBank 3.0: a comprehensive resource for 'omics' research on drugs.|journal=Nucleic Acids Research|volume=39|issue=Database issue|page=D1035–41|doi=10.1093/nar/gkq1126|pmc=3013709|pmid=21059682}}</ref> Оваа верзија содржи 1424 одобрени ситно молекуларни лекови и 132 биотехнолошки лекови, како и повеќе од 4000 уникатни цели за лекови. Верзијата 3.0 исто така вклучуваше податоци за транспортер на лекови, податоци за патека на лекови, цени на лековите, патенти и податоци за производство, како и податоци за повеќе од 5000 експериментални лекови. Верзијата 4.0 беше објавена во 2014 година.<ref name="pmid24203711">{{Наведено списание|last=Law|first=V|last2=Knox|first2=C|last3=Djoumbou|first3=Y|last4=Jewison|first4=T|last5=Guo|first5=AC|last6=Liu|first6=Y|last7=Maciejewski|first7=A|last8=Arndt|first8=D|last9=Wilson|first9=M|date=Jan 2014|title=DrugBank 5.0: shedding new light on drug metabolism|journal=Nucleic Acids Research|volume=42|issue=Database issue|page=D1091-7|doi=10.1093/nar/gkt1068|pmc=3965102|pmid=24203711}}</ref> Оваа верзија вклучуваше 1558 молекуларни лекови одобрени од ФДА, 155 лекови/лекови за биотехника и 4200 уникатни цели на одредени лекови. Верзијата 4.0 исто така опфати широки информации за метаболити на лекови(структури и реакции), таксономија на лекови, спектар на лекови, постојани врски со лекови и информации за синтеза на . Табела 1 дава поцелосно статистичко резиме на историјата и развојот на „DrugBank“.
{| class="wikitable"
|+Табела 1: споредби на опфатнина на различните верзии на DrugBank
Ред 209:
 
* Поддржани се едноставни пребарувања за текст за целата текстуална компонента на базата на податоци. Со кликнување на копчето "Browse", се создава табеларна синопса за содржината на DrugBank. Овој преглед им овозможува на корисниците случајно да се движат низ базата на податоци или повторно да ги сортираат нејзините содржини.
* Со кликнување на даденото копче DrugCard се појавува целокупната содржина на податоци за соодветниот лек. Комплетно објаснување за сите полиња и извори на DrugCard е дадено .
* Копчето PharmaBrowse им овозможува на корисниците да пребаруваат преку лекови, групирани според нивната индикација. Ова е особено корисно за фармацевтите и лекарите, но исто така и за фармацевтските истражувачи кои бараат потенцијални лекови.
* Копчето ChemQuery им овозможува на корисниците да нацртаат (користејќи аплети ChemAxon ) или да напишат (како низа SMILES ) хемиско соединение и да пребаруваат DrugBank за хемикалии слични или идентични со барањето соединение (Слика 3).
Преземено од „https://mk.wikipedia.org/wiki/DrugBank