Хаплогрупа S (mtДНК)

Во човечката генетика, Хаплогрупа S — човечка митохондријална ДНК (mtДНК) хаплогрупа која се наоѓа само кај домородните Австралијци. Тој е потомок на макрохаплогрупата Н.

Хаплогрупа S
Можно време на потекло64,000-47,000 п.н.е.
Можно место на потеклоАвстралија
ПредокN
ПотомциS1, S2, S3, S4, S5, S6
Својствени мутации8404[1]
Карта на Хаплогрупата S mtДНК

Потекло

уреди

Хаплогрупата S mtДНК еволуирала во Австралија пред помеѓу 64.000 и 40.000 години (51 киа).[2]

Распространетост

уреди

Го има кај домородното австралиско население. Хаплогрупата S2 пронајдена во езерата Виландра, човечки остаток WLH4 датира од доцниот холоцен (пред 3.000–500 години).[3][4]

Следната табела ги наведува релевантните примероци на ГенБанк:

Хаплогрупа ГенБанк ID Ера на примерокот Регион
S* KY595638 Модерен Нов Јужен Велс
S1 KY595550 Модерен Квинсленд
S1a DQ404440 Модерен Нов Јужен Велс
S1a DQ404441 Модерен Северна Територија
S1a1 KY595591 Модерен Квинсленд
S1a1a JN226144 Модерен Западна Австралија
S1a1a KY595596 Модерен Квинсленд
S1a1a KY595610 Модерен Квинсленд
S1a1b KY595597 Модерен Квинсленд
S1a1b KY595623 Модерен Квинсленд
S1b1 AF346963 Модерен Северна Територија
S1b1 KY595632 Модерен Квинсленд
S1b1a KY595615 Модерен Квинсленд
S1b1a1 KY595551 Модерен Квинсленд
S1b1a1 KY595559 Модерен Квинсленд
S1b2 KY595560 Модерен Квинсленд
S1b2 KY595566 Модерен Квинсленд
S1b2a KY595620 Модерен Нов Јужен Велс
S1b3 KY595579 Модерен Квинсленд
S1b3a KY595546 Модерен Квинсленд
S1b3a KY595562 Модерен Квинсленд
S1b3a1 KY595547 Модерен Квинсленд
S1b3a1 KY595548 Модерен Квинсленд
S2a AY289051 Модерен Северна Територија
S2a AY289061 Модерен Северна Територија
S2a KY595586 Модерен Квинсленд
S2a KY595604 Модерен Викторија
S2b KY595670 Модерен Тасманија
S2b1a KY595567 Модерен Нов Јужен Велс
S2b1a1 MK165667 Античка Бархам
S2b1a1 MK165668 Античка Бархам
S2b1b KY595616 Модерен Квинсленд
S2b1b KY595664 Модерен Квинсленд
S2b1c KU659023 Античка Регионот на езерата Виландра
S2b1c1 KY595602 Модерен Нов Јужен Велс
S2b1c1 KY595603 Модерен Нов Јужен Велс
S2c JN226145 Модерен Западна Австралија
S2c1 AY289060 Модерен Северна Територија
S2c1 KY595624 Модерен Квинсленд
S2d1 KY595557 Модерен Квинсленд
S2d1a AF346964 Модерен Северна Територија
S2d1a KY595580 Модерен Квинсленд
S2d2 KY595549 Модерен Нов Јужен Велс
S2d2 KY595592 Модерен Квинсленд
S3 AY289066 Модерен Северна Територија
S3 AY289067 Модерен Северна Територија
S4 AY289062 Модерен Северна Територија
S5 EF495220 Модерен Калумбури

Подклади

уреди

Дрво

уреди

Ова филогенетско дрво на подкладите на хаплогрупата S е засновано на трудот на Манис ван Овен и Манфред Кајзер Ажурирано сеопфатно филогенетско дрво на глобалната варијација на човечката митохондријална ДНК и последователните објавени истражувања. TMRCA за хаплогрупата S е помеѓу 49 и 51 ка според варијацијата на Абориџинскиот австралиски митохондријален геном на Нано Нагл - зголемено разбирање за антиката на населението и публикацијата за разновидност објавена во 2017 година.

  • S (64-40 ка) во Австралија
    • S1 (53-32 ка) во Австралија
      • S1a (44-29 ка) пронајден во WA, NT, QLD и NSW
      • S1b (37-22 ка) пронајден во NT, QLD и NSW
        • S1b1 (30-10 ка) пронајден во NT и QLD
          • S1b1a (24-6 ка) пронајден во QLD
        • S1b2 (17-3 ка) пронајден во QLD
        • S1b3 (20-4 ка) пронајден во QLD и NSW
    • S2 (44-22 ка) во Австралија
      • S2a (38-18 ка) пронајден во NT, QLD, NSW и TAS
        • S2a1 (31-12 ка) пронајден во Нов Јужен Велс, QLD и TAS
          • S2a1a (19-6 ка) пронајден во Нов Јужен Велс и QLD
        • S2a2 (38-11 ка) пронајден во NT, QLD и NSW
      • S2b (42-18 ка) пронајден во WA, NT, QLD и VIC
        • S2b1 (27-9 ка) пронајден во NT, QLD и VIC
        • S2b2 (37-12 ка) пронајден во WA, NT и QLD
    • S3 (17-1 ка) пронајден во NT
    • S4 пронајден во NT
    • S5 пронајден во WA
    • S6 пронајден во Нов Јужен Велс

Наводи

уреди
  1. van Oven, Mannis; Kayser, Manfred (February 2009). „Updated comprehensive phylogenetic tree of global human mitochondrial DNA variation“. Human Mutation. 30 (2): E386–E394. doi:10.1002/humu.20921. PMID 18853457. S2CID 27566749.
  2. Nagle, Nano; van Oven, Mannis; Wilcox, Stephen; van Holst Pellekaan, Sheila; Tyler-Smith, Chris; Xue, Yali; Ballantyne, Kaye N.; Wilcox, Leah; Papac, Luka (March 2017). „Aboriginal Australian mitochondrial genome variation – an increased understanding of population antiquity and diversity“. Scientific Reports. 7 (1): 43041. Bibcode:2017NatSR...743041N. doi:10.1038/srep43041. PMC 5347126. PMID 28287095.
  3. Lambert, David; Wright, Joanne; Westaway, Michael; Subramanian, Sankar (8 June 2016). „New DNA study confirms ancient Aborigines were the First Australians“. The Conversation.
  4. Heupink, Tim H.; Subramanian, Sankar; Wright, Joanne L.; Endicott, Phillip; Westaway, Michael Carrington; Huynen, Leon; Parson, Walther; Millar, Craig D.; Willerslev, Eske (21 June 2016). „Ancient mtDNA sequences from the First Australians revisited“. Proceedings of the National Academy of Sciences. 113 (25): 6892–6897. doi:10.1073/pnas.1521066113. PMC 4922152. PMID 27274055.

Надворешни врски

уреди