Тиоредоксински склоп
Тиоредоксински склоп — белковински (белковински) склоп кој е заеднички за ензимите кои го катализираат создавањето на дисулфидните врски и изомеризацијата. Склопот е именуван по тиоредоксинот (класа на мали редокс белковини) и може да се најде и кај прокариотските и кај еукариотските организми. Тој е пример за алфа/бета белковински склоп со оксидоредуктазна активност. Просторната топологија на склопот се состои од четири-верижна антипаралелна бета-плоча, која се наоѓа во сендвич меѓу три алфа-завојницаа. Топологијата на бета нишките е 2134, каде 3 е антипаралелна на останатите.
| Тиоредоксин | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Една молекула на човечки тиоредоксин (PDB ID 1ERT), типичен пример на класата на тиоредоксински склоп. | |||||||||
| Назнаки | |||||||||
| Симбол | Тиоредоксин, Trx | ||||||||
| Pfam | PF00085 | ||||||||
| Pfam-клан | CL0172 | ||||||||
| InterPro | IPR013766 | ||||||||
| PROSITE | PDOC00172 | ||||||||
| SCOP | 3trx | ||||||||
| SUPERFAMILY | 3trx | ||||||||
| CDD | cd01659 | ||||||||
| |||||||||
| Тиоредоксин | |
|---|---|
| Назнаки | |
| Симбол | Trx |
Сочуваност на низата
уредиИ покрај тоа што постои голема варијабилност во низата, тиоредоксинските белковини споделуваат иста низа на активното место, со две реактивни цистеински остатоци: Cys-X-Y-Cys, каде X и Y се често, но не секогаш, хидрофобни аминокиселини. Редуцираната форма на белковината содржи две слободни тиолни групи на цистеинските остатоци, додека оксидираната форма содржи дисулфидна врска меѓу нив.
Формирање на дисулфидни врски
уредиРазличните белковини кои содржат тиоредоксин се разликуваат многу во нивната реактивност и во pKa на нивните слободни тиоли, што произлегува од способноста на целокупната структура на белковината да го стабилизира активираниот тиолат. Иако структурата е прилично доследна меѓу белковините кои го содржат тиоредоксинскиот склоп, pKa вредноста е исклучително чувствителна на мали варијации во структурата, особено поставеноста на атомите од полипептидниот ’рбет во близина на првиот цистеин.
Примери
уредиЧовечки белковини кои го содржат овој склоп се:
- DNAJC10
- ERP70
- GLRX3
- P4HB; P5; PDIA2; PDIA3; PDIA4; PDIA5; PDIA6; PDILT
- QSOX1; QSOX2
- STRF8
- TXN; TXN2; TXNDC1; TXNDC10; TXNDC11; TXNDC13; TXNDC14; TXNDC15; TXNDC16; TXNDC2; TXNDC3; TXNDC4; TXNDC5; TXNDC6; TXNDC8; TXNL1; TXNL3
Наводи
уреди- Creighton TE. (2000). Protein folding coupled to disulphide-bond formation. In Mechanisms of Protein Folding 2nd ed. Editor RH Pain. Oxford University Press.
Надворешни врски
уреди- SCOP тиоредоксинско натсемејство Архивирано на 16 мај 2011 г. (англиски)
- CATH топологија на глутаредоксин Архивирано на 12 март 2007 г. (англиски)