Предвидување на структурата на белковините: Разлика помеѓу преработките
[проверена преработка] | [проверена преработка] |
Избришана содржина Додадена содржина
с →Термини кои се користат за класификација на белковинските структури и секвенци: Правописна исправка, replaced: Белковинска суперфамилиј |
с →Термини кои се користат за класификација на белковинските структури и секвенци: Јазично подобрување, replaced: суперфамилии → натсемејс |
||
Ред 46:
'''[[Белковински домен|Домен]]''' (во контекст на секвенци) е сегмент од полипептидниот синџир кој може да се склопи во тродимензионална структура без оглед на присуството на други сегменти од синџирот. Посебните домени на даден протеин може да стапуваат екстензивно во интеракција или може да бидат споени преку краток дел од полипептидниот синџир. Протеин со неколку домени (мултидоменски протеин) може да ги користи овие домени за функционални интеракции со различни молекули.
'''[[Белковинска фамилија|Фамилија]]''' (во контекст на секвенци) е група на протеини со слична биохемиска функција, кои се повеќе од 50% идентични кога се порамнети. Една белковинска фамилија содржи белковини со иста функција во различни организми (ортологни секвенци), но исто така може да вклучува и белковини во склоп на истиот организам (паралогни секвенци) добиени со генска дупликација и преуредувања. Фамилиите може понатаму да се поделат на [[Белковинска подфамилија|подфамилии]] или да се групираат во
Кога секвенците на протеините со истата функција се испитуваат подетално, за некои се наоѓаа дека имаат голема секвенциска сличност. Според горенаведените критериуми тие се членови на иста фамилија. Сепак, некои имаат многу мала, дури незначајна, секвенциска сличност со другите членови на истата фамилија. Во такви случаи, фамилијарниот однос помеѓу двата далечни членови на истата фамилија А и Ц може да се демонстрира со наоѓање на дополнителен член на семејството, на пример Б, кој има значителна сличност и со А и со Ц. Така, Б обезбедува врска помеѓу А и Ц.
Ред 78:
[[Секундарна структура на белковините|'''Секундарна структура''']] се интеракциите кои се одвиваат помеѓу C, O, и NH групите на аминокиселините во полипептидниот синџир за да формираат α-завојницаи, β-плочи, свиоци, петелки и други форми, и кои го олеснуваат склопувањето во тродимензионална структура.
[[Белковинско натсемејство|'''Натсемејство''']] е група на белковински фамилии кои имаат мала но детектибилна сличност во секвенците. Припадниците на една суперфамилија имаат заедничко еволутивно потекло. Протеини со неколку идентитети во порамнувањето на секвенците, но со заеднички број на структурни и функционални карактеристики се класифицирани во истата суперфамилија. На ниво на тродимензионална структура, протеините од иста суперфамилија споделуваат заеднички структурни карактеристики, како што е заеднички склоп, но може да имаат разлики во бројот и распоредот на секундарните структури. PIR ресурсот го користи терминот хомеоморфни
'''Суперсекундарна структура''' е термин кој има слично значење со терминот структурен мотив.<ref name="Mount"/>
|