Во 1689, Пиколомини раководел со автономна армија од 4000 војници со задача да ги освои Косово, Босна, Македонија и МакедонијаВрање. Тој го зема Врање и го остава еден германски благородник Јурген фон Лам за да владее со градот. Ова било контраофанзива против [[Отоманската империја]] по кампањата на Турците во 1683 во која за малку ќе ја освоеле и [[Виена]]. Но, во тоа време Скопје го зафатила епидемија на [[колера]]. Пиколомини наредил градот да се запали за да се сопре епидемијата. Скопје било запалено и горело два дена. До темел изгореле голем број куќи и дуќани, но епидемијата не сопрела. Дури и самиот генерал Пиколомини се заразил и набрзо умрел.