Gemmatimonadetes
| Gemmatimonadetes | |
|---|---|
| Научна класификација | |
| Домен: | Bacteria |
| Колено: | Gemmatimonadetes Zhang et al. 2003 |
| Класи | |
| |
| Синоними | |
| |
Gemmatimonadetes е колено на бактерии создадено за видот Gemmatimonas aurantiaca. Оваа Грам-негативна бактерија сочинува околу 2% од почвените бактериски заедници, а коленото на кое припаѓа е идентификувано како едно од првите девет колена по застапеност во почви.[1] Gemmatimonadetes се најдени во различни суви почви, како што се тревни површини, прерии и пасишта, како и во еутрофични езерски седименти и алпски почви. Овој широк дијапазон на средини каде Gemmatimonadetes биле пронајдени сугерира дека тие се адаптирани на ниско ниво на влага во почвата.[2] Според една студија, дистрибуцијата на Gemmatimonadetes во почвата има тенденција да биде повеќе зависна од достапноста на влага отколку од агрегацијата, потврдувајќи го верувањето дека членовите на ова колено претпочитаат посуви почви.[1] Исто така, неодамна беше откриен нов вид на ова колено кој е способен за фотосинтеза.[3]
Првиот член на ова колено беше откриен во 2003 година, во активна мил добиена од третман на отпадни води и беше именуван Gemmatimonas aurantiaca.[4] Метаболичките патишта и ензимите на оваа бактерија се уникатни во бактерискиот свет, а таа е способна и за анаеробна и за аеробна респирација.[5]
Таксономија
уредиМоментално прифатената таксономија е заснована на Списокот на имиња на прокариотите со евиденција во номенклатурата (анг. List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature - LPSN),[6] Националниот центар за биотехнолошки информации (анг. National Center for Biotechnology Information - NCBI) [7] и Проектот "Животно дрво на сите видови" (анг. The All-Species Living Tree Project).[8]
- Колено Gemmatimonadetes Zhang et al. 2003 [Gemmatimonadaeota Oren et al. 2015]
- Класа Longimicrobia Pascual et al. 2016
- Ред Longimicrobiales Pascual et al. 2016
- Фамилија Longimicrobiaceae Pascual et al. 2016
- Род Longimicrobium Pascual et al. 2016
- Вид Longimicrobium terrae Pascual et al. 2016
- Вид Longimicrobium terrae Pascual et al. 2016
- Род Longimicrobium Pascual et al. 2016
- Фамилија Longimicrobiaceae Pascual et al. 2016
- Ред Longimicrobiales Pascual et al. 2016
- Класа Gemmatimonadetes Zhang et al. 2003
- Ред Gemmatimonadales Zhang et al. 2003
- Фамилија Gemmatimonadaceae Zhang et al. 2003
- Род Gemmatirosa DeBruyn et al. 2013
- Вид Gemmatirosa kalamazoonesis DeBruyn et al. 2013
- Род Gemmatimonas Zhang et al. 2003 emend. Zeng et al. 2015 [Gemmimonas(sic)]
- Вид G. phototrophica Zeng et al. 2015
- Вид G. aurantiaca Zhang et al. 2003 emend. Zeng et al. 2015 [Gemmimonas aurantiaca (sic)]
- Род Gemmatirosa DeBruyn et al. 2013
- Фамилија Gemmatimonadaceae Zhang et al. 2003
- Ред Gemmatimonadales Zhang et al. 2003
- Класа Longimicrobia Pascual et al. 2016
Поврзано
уредиНаводи
уреди- ↑ 1,0 1,1 Fawaz, Mariam (2013). „Revealing the Ecological Role of Gemmatimonadetes Through Cultivation and Molecular Analysis of Agricultural Soils“. Master's Thesis, University of Tennessee: vi.
- ↑ DeBruyn, J; Nixon, L; Fawaz, M; Johnson, M; Radosevich, M (2011). „Global Biogeography and Quantitative Season Dynamics of Gemmatimonadetes in Soil“. Appl. Environ. Microbiol. 77 (17): 6295–300. doi:10.1128/AEM.05005-11. PMC 3165389. PMID 21764958.
- ↑ Zeng, Yonghui; Selyanin, Vadim; Lukeš, Martin; Dean, Jason; Kaftan, David; Feng, Fuying; Koblížek, Michal (2015). „Characterization of the microaerophilic, bacteriochlorophyll a-containing bacterium Gemmatimonas phototrophica sp. nov., and emended descriptions of the genus Gemmatimonas and Gemmatimonas aurantiaca“. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 65 (8): 2410–2419. doi:10.1099/ijs.0.000272.
- ↑ Zhang H, Sekiguchi Y, Hanada S, Hugenholtz P, Kim H, Kamagata Y, Nakamura K (2003). „Gemmatimonas aurantiaca gen. nov., sp. nov., a gram-negative, aerobic, polyphosphate-accumulating micro-organism, the first cultured representative of the new bacterial phylum Gemmatimonadetes phyl. nov“. Int J Syst Evol Microbiol. 53 (Pt 4): 1155–63. doi:10.1099/ijs.0.02520-0. PMID 12892144.
- ↑ Takaichi, S; Maoka, T; Takasaki, K; Hanada, S (2009). „Carotenoids of Gemmatimonas aurantiaca (Gemmatimonadetes): identification of a novel carotenoid, deoxyoscillol 2-rhamnoside, and proposed biosynthetic pathway of oscillol 2,2′-dirhamnoside“. Microbiology. 156 (3): 757–763. doi:10.1099/mic.0.034249-0. PMID 19959572.
- ↑ J.P. Euzéby. „Gemmatimonadetes“. List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN). Посетено на 2016-03-20.
- ↑ Sayers; и др. „Gemmatimonadetes“. National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database. Посетено на 2016-03-20.
- ↑ „16S rRNA-based LTP release 123 (full tree)“ (PDF). Silva Comprehensive Ribosomal RNA Database. Архивирано од изворникот (PDF) на 2019-06-07. Посетено на 2016-03-20.
Надворешни врски
уреди- Кратка таксономија Архивирано на 29 септември 2007 г. (англиски)
- Fawaz, М. N. (2013). Revealing the Ecological Role of Gemmatimonadetes Through Cultivation and Molecular Analysis of Agricultural Soils. 44-60. Краток преглед на коленото.