Пелагонија има претежно [[умерено - континенталнаумереноконтинентална клима]], но негогаш во зимските месеци во неа продираат студени влијанија од север, кои навистина ја снижуваат температурата и ѝ даваат карактер на [[континентална клима]]. Поради близината на [[Егејско Море|Егејското Море]] и географскаташирочина би требало да владее средоземноморската клима, но заради големата надморска височина владее умерено-континенталната клима. Средната годишна температура на воздухот во [[Прилеп]] и [[Битола]] е 11,2 °С<ref>МАКЕДОНСКА енциклопедија. Том II, MАНУ, Скопје 2009. стр.1128-1129</ref>. Просечните врнежи изнесуваат околу 640 мм, во Прилеп се 556,7 мм, а во Битола 602 мм.
[[Податотека:Fortress Towers of Marko2.jpg|мини|250px|right|Месноста Заград, Прилепско Поле.]]
