Директно повторување

Директните повторувања се вид на генетска секвенца која се состои од две или повеќе повторувања на одредена секвенца.^[1] Со други зборови, директните повторувања се нуклеотидни секвенци присутни во повеќе копии во геномот. Општо земено, директно повторување се случува кога низата се повторува со истата шема низводно.^[1] Нема инверзија и нема обратно дополнување поврзано со директно повторување. Може или не мора да има интервентни нуклеотиди. Нуклеотидната низа напишана со задебелени знаци ја означува повторената низа.

5´ TTACGnnnnnnTTACG 3´

3´ AATGCnnnnnnAATGC 5´

Лингвистички, типичното директно повторување е споредливо со кажувањето „чао-чао“.^[1]

Видови

Постојат неколку видови на повторени секвенци:

Прошарани (или дисперзирани) повторувања на ДНК (прошарани повторувачки секвенци) се копии на транспонирани елементи прошарани низ геномот.
Крајните (или терминални) повторувања (терминални повторувачки секвенци) се секвенци кои се повторувале на двата краја на низата, на пример, долгите терминални повторувања (LTRs) на ретровирусите. Директните терминални повторувања се во иста насока, а превртените терминални повторувања се спротивни едни на други во насока.
Тандем повторувања (тандем повторувачки секвенци) се повторени копии кои лежеле една до друга. Овие можеле да бидат и директни или превртени повторувања. Рибозомните РНК и транспортните РНК гени припаѓале на класата на средно повторувачка ДНК.

Микросателитска ДНК

Тракт на повторлива ДНК во кој мотив од неколку базни парови се повторува многу пати (на пр. 5 до 50 пати) се нарекува микросателитска ДНК. Така директно повторувачките тандем секвенци се форма на микросателитска ДНК. Процесот на поправка на неусогласеноста на ДНК игра значајна улога во формирањето на директни тринуклеотидни повторувачки експанзии.^[2] Ваквите повторливи проширувања се во основата на неколку невролошки и развојни нарушувања кај луѓето.^[2]

Хомологна рекомбинација

Во директно повторени секвенци на геномот на растението тутун, прекините на ДНК со двојни жици може ефикасно да се поправат со хомологна рекомбинација помеѓу повторените секвенци.^[3]

Поврзано

Превртено повторување

Наводи

↑ ^1,0 ^1,1 ^1,2 Ussery, David W.; Wassenaar, Trudy; Borini, Stefano (2008-12-22). „Word Frequencies, Repeats, and Repeat-related Structures in Bacterial Genomes“. Computing for Comparative Microbial Genomics: Bioinformatics for Microbiologists. Computational Biology. 8 (1. изд.). Springer. стр. 133–144. ISBN 978-1-84800-254-8.
↑ ^2,0 ^2,1 Richard, G. F. (2021). „The Startling Role of Mismatch Repair in Trinucleotide Repeat Expansions“. Cells. 10 (5): 1019. doi:10.3390/cells10051019. PMC 8145212 Проверете ја вредноста |pmc= (help). PMID 33925919 Проверете ја вредноста |pmid= (help).
↑ Siebert R, Puchta H. Efficient repair of genomic double-strand breaks by homologous recombination between directly repeated sequences in the plant genome. Plant Cell. 2002 May;14(5):1121-31. doi: 10.1105/tpc.001727. PMID: 12034901; PMCID: PMC150611

[Ussery2008-1] 1,0 ^1,1 ^1,2 Ussery, David W.; Wassenaar, Trudy; Borini, Stefano (2008-12-22). „Word Frequencies, Repeats, and Repeat-related Structures in Bacterial Genomes“. Computing for Comparative Microbial Genomics: Bioinformatics for Microbiologists. Computational Biology. 8 (1. изд.). Springer. стр. 133–144. ISBN 978-1-84800-254-8.

[Richard2021-2] 2,0 ^2,1 Richard, G. F. (2021). „The Startling Role of Mismatch Repair in Trinucleotide Repeat Expansions“. Cells. 10 (5): 1019. doi:10.3390/cells10051019. PMC 8145212 Проверете ја вредноста |pmc= (help). PMID 33925919 Проверете ја вредноста |pmid= (help).

[3] Siebert R, Puchta H. Efficient repair of genomic double-strand breaks by homologous recombination between directly repeated sequences in the plant genome. Plant Cell. 2002 May;14(5):1121-31. doi: 10.1105/tpc.001727. PMID: 12034901; PMCID: PMC150611

[1]

[2]

[3]