Директно повторување

Директните повторувања биле вид на генетска секвенца која се состоела од две или повеќе повторувања на одредена секвенца.^[1] Со други зборови, директните повторувања биле нуклеотидни секвенци присутни во повеќе копии во геномот. Општо земено, директно повторување се случувало кога низата се повторувала со истата шема низводно.^[1] Немало инверзија и немало обратно дополнување поврзано со директно повторување. Можело или не морало да има интервентни нуклеотиди. Нуклеотидната низа напишана со задебелени знаци ја означувала повторената низа.

5´ TTACGnnnnnnTTACG 3´

3´ AATGCnnnnnnAATGC 5´

Лингвистички, типичното директно повторување било споредливо со кажувањето „чао“.^[1]

Видови уреди

Постоеле неколку видови на повторени секвенци:

Прошарани (или дисперзирани) повторувања на ДНК (прошарани повторувачки секвенци) биле копии на транспонирани елементи прошарани низ геномот.
Крајните (или терминални) повторувања (терминални повторувачки секвенци) биле секвенци кои се повторувале на двата краја на низата, на пример, долгите терминални повторувања (LTRs) на ретровирусите. Директните терминални повторувања биле во иста насока, а превртените терминални повторувања биле спротивни едни на други во насока.
Тандем повторувања (тандем повторувачки секвенци) биле повторени копии кои лежеле една до друга. Овие можеле да бидат и директни или превртени повторувања. Рибозомалните РНК и трансферните РНК гени припаѓале на класата на средно повторувачка ДНК.

Микросателитска ДНК уреди

Тракт на повторлива ДНК во кој мотив од неколку базни парови се повторувал многу пати (на пр. 5 до 50 пати) се нарекувал микросателитска ДНК. Така директно повторувачките тандем секвенци биле форма на микросателитска ДНК. Процесот на поправка на неусогласеноста на ДНК играл значајна улога во формирањето на директни тринуклеотидни повторувачки експанзии.^[2] Ваквите повторливи проширувања биле во основата на неколку невролошки и развојни нарушувања кај луѓето.^[2]

Хомологна рекомбинација уреди

Во директно повторени секвенци на геномот на растението тутун, прекините на ДНК со двојни жици можеле ефикасно да се поправеле со хомологна рекомбинација помеѓу повторените секвенци.^[3]

Поврзано уреди

Превртено повторување

Наводи уреди

↑ ^1,0 ^1,1 ^1,2 Ussery, David W.; Wassenaar, Trudy; Borini, Stefano (2008-12-22). „Word Frequencies, Repeats, and Repeat-related Structures in Bacterial Genomes“. Computing for Comparative Microbial Genomics: Bioinformatics for Microbiologists. Computational Biology. 8 (1. изд.). Springer. стр. 133–144. ISBN 978-1-84800-254-8.
↑ ^2,0 ^2,1 Richard, G. F. (2021). „The Startling Role of Mismatch Repair in Trinucleotide Repeat Expansions“. Cells. 10 (5): 1019. doi:10.3390/cells10051019. PMC 8145212 Проверете ја вредноста |pmc= (help). PMID 33925919 Проверете ја вредноста |pmid= (help).
↑ Siebert R, Puchta H. Efficient repair of genomic double-strand breaks by homologous recombination between directly repeated sequences in the plant genome. Plant Cell. 2002 May;14(5):1121-31. doi: 10.1105/tpc.001727. PMID: 12034901; PMCID: PMC150611

[Ussery2008-1] 1,0 ^1,1 ^1,2 Ussery, David W.; Wassenaar, Trudy; Borini, Stefano (2008-12-22). „Word Frequencies, Repeats, and Repeat-related Structures in Bacterial Genomes“. Computing for Comparative Microbial Genomics: Bioinformatics for Microbiologists. Computational Biology. 8 (1. изд.). Springer. стр. 133–144. ISBN 978-1-84800-254-8.

[Richard2021-2] 2,0 ^2,1 Richard, G. F. (2021). „The Startling Role of Mismatch Repair in Trinucleotide Repeat Expansions“. Cells. 10 (5): 1019. doi:10.3390/cells10051019. PMC 8145212 Проверете ја вредноста |pmc= (help). PMID 33925919 Проверете ја вредноста |pmid= (help).

[3] Siebert R, Puchta H. Efficient repair of genomic double-strand breaks by homologous recombination between directly repeated sequences in the plant genome. Plant Cell. 2002 May;14(5):1121-31. doi: 10.1105/tpc.001727. PMID: 12034901; PMCID: PMC150611

[1]

[2]

[3]