Хаплогрупа L5

Хаплогрупа L5
Можно време на потекло	114,200-126,200 п.н.е.
Можно место на потекло	Источна Африка
Предок	L2-6
Потомци	L5a, L5c
Својствени мутации	3423, 7972, 12432, 12950

Хаплогрупа L5 — клад на човечка митохондријална ДНК (mtДНК). Претходно беше познат како L1e.

Распространетост

L5 е мала хаплогрупа со центар во Источна Африка. Највисока честота има во Мбути пигмеите од Источна Централна Африка со 15%.^[3] Присутен е на релативно мали честоти во Танзанија (Сандаве и други), Кенија, Чад, Етиопија, Судан, Нубија, Египет^[4] и Саудиска Арабија.^[5]

Хаплогрупата L5 е забележана меѓу примероците на островските гробишта во Кулубнарти, Судан, кои датираат од ранохристијанскиот период (550–800 година од нашата ера).^[6]

Подклади

Дрво

Ова филогенетско стебло на хаплогрупата L5 подклади се заснова на трудот на Манис ван Овен и Манфред Кајзер Ажурирано сеопфатно филогенетско дрво на глобалната варијација на човечката митохондријална ДНК и последователните објавени истражувања.

Најновиот заеднички предок (MRCA)
- L1-6
  - L2-6
    - L5
      - L5a
        L5a1
        L5a1a
        
        L5a1b
        
        L5a1c
        
        L5a2
      - L5c
        L5c1
        
        L5c2

Наводи

↑ Soares, P; Ermini, L; Thomson, N; Mormina, M; Rito, T; Röhl, A; Salas, A; Oppenheimer, S; MacAulay, V (2009). „Correcting for Purifying Selection: An Improved Human Mitochondrial Molecular Clock“. American Journal of Human Genetics. 84 (6): 740–59. doi:10.1016/j.ajhg.2009.05.001. PMC 2694979. PMID 19500773.
↑ van Oven, Mannis; Manfred Kayser (13 Oct 2008). „Updated comprehensive phylogenetic tree of global human mitochondrial DNA variation“. Human Mutation. 30 (2): E386–E394. doi:10.1002/humu.20921. PMID 18853457. S2CID 27566749.
↑ Sarah A. Tishkoff et al. 2007, History of Click-Speaking Populations of Africa Inferred from mtDNA and Y Chromosome Genetic Variation.
↑ Stevanovitch, A; A. Gilles; E. Bouzaid; R. Kefi; F. Paris; R. P. Gayraud; J. L. Spadoni; F. El-Chenawi; E. Béraud-Colomb (29 Jan 2004). „Mitochondrial DNA Sequence Diversity in a Sedentary Population from Egypt“. Annals of Human Genetics. 68 (1): 23–39. doi:10.1046/j.1529-8817.2003.00057.x. PMID 14748828.
↑ Abu-Amero et al. 2008 February.
↑ Sirak, Kendra; Frenandes, Daniel; Novak, Mario; Van Gerven, Dennis; Pinhasi, Ron (2016). „Abstract Book of the IUAES Inter-Congress 2016 - A community divided? Revealing the community genome(s) of Medieval Kulubnarti using next- generation sequencing“. Abstract Book of the Iuaes Inter-Congress 2016. IUAES: 115.

Надворешни врски

Општо
- Phylotree на Манис ван Овен
Хаплогрупа L5
- Хаплоггрупа L5 на Иан Логан
- YFull MTree's Haplogroup L5
- Хаплоггрупа L5 на MITOMAP

[soares-1] Soares, P; Ermini, L; Thomson, N; Mormina, M; Rito, T; Röhl, A; Salas, A; Oppenheimer, S; MacAulay, V (2009). „Correcting for Purifying Selection: An Improved Human Mitochondrial Molecular Clock“. American Journal of Human Genetics. 84 (6): 740–59. doi:10.1016/j.ajhg.2009.05.001. PMC 2694979. PMID 19500773.

[vanOven-2] van Oven, Mannis; Manfred Kayser (13 Oct 2008). „Updated comprehensive phylogenetic tree of global human mitochondrial DNA variation“. Human Mutation. 30 (2): E386–E394. doi:10.1002/humu.20921. PMID 18853457. S2CID 27566749.

[3] Sarah A. Tishkoff et al. 2007, History of Click-Speaking Populations of Africa Inferred from mtDNA and Y Chromosome Genetic Variation.

[Stevanovitch-4] Stevanovitch, A; A. Gilles; E. Bouzaid; R. Kefi; F. Paris; R. P. Gayraud; J. L. Spadoni; F. El-Chenawi; E. Béraud-Colomb (29 Jan 2004). „Mitochondrial DNA Sequence Diversity in a Sedentary Population from Egypt“. Annals of Human Genetics. 68 (1): 23–39. doi:10.1046/j.1529-8817.2003.00057.x. PMID 14748828.

[5] Abu-Amero et al. 2008 February.

[6] Sirak, Kendra; Frenandes, Daniel; Novak, Mario; Van Gerven, Dennis; Pinhasi, Ron (2016). „Abstract Book of the IUAES Inter-Congress 2016 - A community divided? Revealing the community genome(s) of Medieval Kulubnarti using next- generation sequencing“. Abstract Book of the Iuaes Inter-Congress 2016. IUAES: 115.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

Хаплогрупа L5
Можно време на потекло	114,200-126,200 п.н.е.^[1]
Можно место на потекло	Источна Африка
Предок	L2-6
Потомци	L5a, L5c
Својствени мутации	3423, 7972, 12432, 12950^[2]