Википедија

Упростен систем за заведување во редови со молекуларен внос: Разлика помеѓу преработките

Поново уредување →
Избришана содржина Додадена содржина
НагледноВикитекст
Создадено преведувајќи ја страницата „Simplified molecular-input line-entry system“
(нема разлика)

Преработка од 11:48, 21 јануари 2022

Упростен систем за заведување во редови со молекуларен внос ( УСЗРМВ ) е спецификација во форма на линиска запис за опишување на структурата на хемиските видови користејќи кратки ASCII низи . Низите создадени од УСЗРМВ може да се употребат од повеќето молекуларни уредувачи за претворање во во дводимензионални цртежи или тродимензионални модели на молекулите.

Алгоритам за создавање на УСЗРМВ за Ципрофлоксацин : прекинувачки циклуси, подоцна запишани како како гранки од главниот скелет

Оригиналната спецификација за УСЗРМВ беше создадена во 1980-ите. Оттогаш е изменет и проширен. Во 2007 година, е развиен слободен стандард наречен СУСЗРМВ од страна на хемиската заедница.

Историја

Оригиналната спецификација SMILES била идеја на Дејвид Вајнингер вработен во еколошкиот оддел на лабораторијата о средниот континент USEPA во Дулут во 1980-ите.[1][2][3][4] Дополнително заслужни се и Гилман Вејт и Роуз Русо и Алберт Лео и Корвин Ханш за поддршка на работата, и Артур Вајнингер и Џереми Скофилд за помошта во програмирањето на системот.[5] Агенцијата за заштита на животната средина го финансирала почетниот проект за развој на УСЗРМВ.[6] [7]

Оттогаш е изменуван и прошируван од други допринесувачи, особено од Дневни хемиски информациски системи. Во 2007 година, слободниот стандард наречен „СУСЗРМВ“ бил развиен од Син Обелиск заедница од хемичари поддржувачи на за слободен код. Други „линиски“ ознаки ги вклучуваат и Висвесерово линиско запишување (WLN), РОСДАЛ и SLN (Tripos Inc).

Во јули 2006 година, IUPAC го воведеува InChI како стандард за претставување на формулите. Генерално се смета дека УСЗРМВ има предност над InChI поради полесното читање за оние кои не се хемичари, исто така има широка база на софтверска поддршка со обемно теоретско поддржување (како што е теоријата на графикони).

Поими

  1. ↑ Weininger, David (February 1988). „SMILES, a chemical language and information system. 1. Introduction to methodology and encoding rules“. Journal of Chemical Information and Computer Sciences. 28 (1): 31–6. doi:10.1021/ci00057a005.
  2. ↑ Weininger, David; Weininger, Arthur; Weininger, Joseph L. (May 1989). „SMILES. 2. Algorithm for generation of unique SMILES notation“. Journal of Chemical Information and Modeling. 29 (2): 97–101. doi:10.1021/ci00062a008.
  3. ↑ Weininger, David (August 1990). „SMILES. 3. DEPICT. Graphical depiction of chemical structures“. Journal of Chemical Information and Modeling. 30 (3): 237–43. doi:10.1021/ci00067a005.
  4. ↑ Swanson, Richard Pommier (2004). „The Entrance of Informatics into Combinatorial Chemistry“ (PDF). Во Rayward, W. [Warden] Boyd; Bowden, Mary Ellen (уред.). The History and Heritage of Scientific and Technological Information Systems: Proceedings of the 2002 Conference of the American Society of Information Science and Technology and the Chemical Heritage Foundation. Medford, NJ: Information Today. стр. 205. ISBN 9781573872294.
  5. ↑ Weininger, Dave (1998). „Acknowledgements on Daylight Tutorial smiles-etc page“. Посетено на 24 June 2013.
  6. ↑ Anderson, E.; Veith, G. D.; Weininger, D. (1987). SMILES: A line notation and computerized interpreter for chemical structures (PDF). Duluth, MN: U.S. EPA, Environmental Research Laboratory-Duluth. Report No. EPA/600/M-87/021.
  7. ↑ „SMILES Tutorial: What is SMILES?“. U.S. EPA. Посетено на 2012-09-23.
Преземено од „https://mk.wikipedia.org/w/index.php?title=Упростен_систем_за_заведување_во_редови_со_молекуларен_внос&oldid=4719041“