Лобато му се приклучил на {{ct|MOV|2014|nolink=yes}} за сезоната 2014 откако неговата мината екипа, {{ct|EUS|2013}}<ref>{{citeнаведени newsвести|url= http://www.cyclingweekly.co.uk/news/latest/535965/euskaltel-to-sell-team-vehicles-to-balance-books.html|title=Euskaltel to sell team vehicles to balance books|date=10 декември 2012|first=Грегор|last= Браун|accessdate=5 јануари 2013|work=Cycling Weekly|publisher=IPC Media Ltd.|quote=Потпишале 11 нови велосипедист: Јон Аберастури Изага (Шпанија), Гарикоиц Браво Оијарбиде (Шпанија), Хуан Хосе Лобато дел Вале (Шпанија), Тарик Шауфи (Мароко), Јуре Коцјан (Словенија), Роберт Вречер (Словенија), Рикардо Хорхе Кореја Местре (Португалија), Штефен Радохла (Германија), Андре Шулце (Германија), Александар Серебрјаков (Русија) и Јоанис Тамуридис (Грција).}}</ref>, се распаднала на крајот на сезоната 2013.<ref name="Movistar">{{citeнаведени newsвести|url=http://www.cyclingnews.com/news/movistar-sign-sprinter-juanjo-lobato-for-2014|title=Мувистар потпиша со спринтерот Хуанхо Лобато за 2014|first=Стивен|last=Фаранд|work=Cyclingnews.com|publisher=Future plc|date=28 октомври 2013|accessdate=21 декември 2013}}</ref>
Подоцна потпишал двегодишен договор со {{ct|TLJ|2017}} почнувајќи од 2017.<ref name="TLJ">{{citeнаведени newsвести|url=http://www.cyclingnews.com/news/juan-jose-lobato-signs-for-lottonl-jumbo/|title=Juan Jose Lobato signs for LottoNL-Jumbo|work=Cyclingnews.com|publisher=Future plc|date=1 август 2016|accessdate=3 јануари 2018}}</ref> Во декември 2017 година, договорот на Лобато бил прекинат, поради поседување апчиња за спиење на тренинг-камп пред сезоната, нарушувајќи ги внатрешните правила на екипата.<ref>{{citeнаведени newsвести|url=http://www.cyclingnews.com/news/lottonl-jumbo-fire-lobato-after-sleep-medication-fiasco/|title=LottoNL-Jumbo fire Lobato after sleep medication fiasco|first=Даниел|last=Бенсон|work=Cyclingnews.com|publisher=Immediate Media Company |accessdate=3 јануари 2018|date=18 декември 2017}}</ref>
