Википедија

Предвидување на структурата на белковините: Разлика помеѓу преработките

Интерактивен преглед на историјата
[проверена преработка][проверена преработка]
← Постаро уредувањеПоново уредување →
Избришана содржина Додадена содржина
НагледноВикитекст
сНема опис на уредувањето
Ред 1:
 
[[Податотека:Protein-structure.png|мини|Составните аминокиселини на една белковина може да бидат анализирани за да се предвиди секундарната, терциернататерцијарната и квартерната структура на таа белковина.|алт=|336x336пкс]]
'''Предвидување на структурата на белковините''' е— процесотпроцес на изведување на тродимензионалната структура на [[Белковина|белковините]] од нивната [[Аминокиселина|аминокиселинска]] секвенца, т.е., предвидувањето на нивното [[Склопување на белковините|склопување]] и нивната [[Секундарна структура на белковините|секундарна]] и [[ТерциернаТерцијарна структура на белковините|терциернатерцијарна структура]] од нивната [[Примарна структура на белковините|примарна структура]]. Предвидувањето на структурата е фундаментално различен проблем од инверзниот проблем на [[дизајнирање на белковини]]. Предвидување на структурата е една од најважните дејности на [[Биоинформатика|биоинформатиката]] и [[Теоретска хемија|теоретската хемија]], која е мошне значајна во [[Медицина|медицината]] (на пример, за [[Дизајнирање на лекови|дизајнирање на нови лекови]]) и во [[Биотехнологија|биотехнологијата]] (за пример, за дизајнирање на нови [[Ензим|ензими]]). Секои две години, перформансите на постојните методи се оценуваат со [[CASP]] експериментот (од [[Англиски јазик|анг.]] Critical Assessment of Techniques for Protein Structure Prediction - критична процена на техники за предвидување на структурата на белковините). Континуирана проценка на веб серверите за предвидувањето на структурата на белковините се врши од страна на проектот [[CAMEO3D]] (од анг. Continuous Automated Model EvaluatiOn).
 
== Структура на белковините и терминологија ==
Ред 33:
Најчесто користените термини за еволутивни и структурни односи помеѓу протеините се наведени подолу. Разни дополнителни термини се користат за различни видови на структурни карактеристики кои се среќаваат кај протеините. Описи на такви термини можат да се најде на [[CATH]] веб-сајтот, [[структурна класификација на белковините]] (SCOP) веб-сајтот, и Glaxo-Wellcome туторијалот на Swiss bioinformatics Expasy веб-сајтот.
 
'''[[Активно место]]''' е локализирана комбинација на аминокиселински странични групи во рамките на [[ТерциернаТерцијарна структура на белковините|терциернататерцијарната]] (тродимензионална) или [[Квартерна структура на белковините|квартерна]] (протеинска подединица) структура која може да стапува во интеракција со хемиски специфичен [[супстрат]] и која ја дава биолошката активност на протеинот. Протеините со многу различни аминокиселински секвенци може да се склопат во структура со исто активно место.
 
'''Архитектура''' е релативната ориентација на секундарните структури во тродимензионалната структура, без разлика на тоа дали тие споделуваат слична структура на петелките или не.
Ред 88:
Најдобрите денешни методи за предвидување на секундарната структура на белковините достигнуваат точност од околу 80%;<ref>{{Наведено списание|last=Pirovano|first=W.|last2=Heringa|first2=J.|year=2010|title=Protein secondary structure prediction|journal=Methods Mol Biol|series=Methods in Molecular Biology|volume=609|issue=|pages=327–48|doi=10.1007/978-1-60327-241-4_19|isbn=978-1-60327-240-7|pmid=20221928}}</ref> оваа висока точност овозможува користење на предвидувањата како алатка за подобрување на препознавањето на склоповите (анг. fold recognition) и ''ab initio'' предвидувањето на структурата на белковините, класификација на структурните мотиви и подобрување на порамнувањето на секвенците. Точноста на денешните методи за предвидување на структурата на белковините се проценува со неделни [[Бенчмарк (информатика)|бенчмаркови]], како што се [[LiveBench]] и [[EVA (бенчмарк)|EVA]].
 
== ТерциернаТерцијарна структура ==
Практичната примена на предвидувањето на белковинската структура денес е поважна од било кога. Постојано се продуцираат огромни количества на податоци за белковински секвенци од проектите на ДНК секвенционирање, како што е [[Проект за човечки геном|Проектот за човечки геном]]. И покрај напорите на полето на [[Структурна геномика|структурната геномика]], создавањето на експериментално потврдени белковински структури (обично со помош на бавни и релативно скапи методи на [[рендгенска кристалографија]] или [[NMR спектроскопија]]) значително заостанува зад продукцијата на нови белковински секвенци.
 
Преземено од „https://mk.wikipedia.org/wiki/Предвидување_на_структурата_на_белковините“