Бактерии: Разлика помеѓу преработките

Повеќето бактерии немаат јадро оградено со мембрана, а нивниот [[генетски материјал]] е единечен, циркуларен, бактериски [[хромозом]], лоциран во цитоплазмата во облик на телце со неправилна форма кое се нарекува ''[[нуклеоид]]''.<ref>{{Наведено списание|last=Thanbichler|first=Martin|last2=Wang|first2=Sherry C.|last3=Shapiro|first3=Lucy|date=2005-10-15|title=The bacterial nucleoid: A highly organized and dynamic structure|url=http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/jcb.20519/abstract|journal=Journal of Cellular Biochemistry|language=en|volume=96|issue=3|pages=506–521|doi=10.1002/jcb.20519|issn=1097-4644}}</ref> Како и сите други живи организми бактериите поседуваат [[Рибозом|рибозоми]], кои се неопходни во процесот на [[Биосинтеза на протеини|синтеза на протеини]]; но структурата на бактериските рибозоми е различна од онаа кај [[Археи|археите]] и [[Еукариоти|еукариотите]].<ref>{{Наведено списание|last=Poehlsgaard|first=Jacob|last2=Douthwaite|first2=Stephen|date=2005/11|title=The bacterial ribosome as a target for antibiotics|url=https://www.nature.com/articles/nrmicro1265|journal=Nature Reviews Microbiology|language=En|volume=3|issue=11|pages=870–881|doi=10.1038/nrmicro1265|issn=1740-1534}}</ref>

[[Класификација на живиот свет|Класификацијата]] има за цел да го опише диверзитетот на бактериските [[Вид (биологија)|видови]] со нивно именување и организирање во групи на основа на сличности. Бактериите може да се класифицираат на основа на нивната клеточна структура, [[метаболизам]] или разлики во клеточните компоненти како што се [[ДНК]], [[РНК]], [[Масна киселина|масни киселини]], [[пигменти]], [[Антиген|антигени]], [[Хинон|хинони]] итн. Додека овие критериуми овозможија идентификација и класификација на типови на бактерии, не беше јасно дали овие разлики претставуваат варијација помеѓу различни видови или помеѓу подгрупи кои припаѓаат на истот вид. Оваа несигурност се должеше на недостатокот на својствени структури кај повеќето бактерии како и на [[Хоризонтален трансферпренос на гени|хоризонталниот трансфер на гени]] помеѓу несродни видови.<ref>{{Наведено списание|last=Boucher|first=Yan|last2=Douady|first2=Christophe J.|last3=Papke|first3=R. Thane|last4=Walsh|first4=David A.|last5=Boudreau|first5=Mary Ellen R.|last6=Nesbø|first6=Camilla L.|last7=Case|first7=Rebecca J.|last8=Doolittle|first8=W. Ford|date=2003-11-28|title=Lateral Gene Transfer and the Origins of Prokaryotic Groups|url=http://www.annualreviews.org/doi/10.1146/annurev.genet.37.050503.084247|journal=Annual Review of Genetics|volume=37|issue=1|pages=283–328|doi=10.1146/annurev.genet.37.050503.084247|issn=0066-4197}}</ref> Како резултат на хоризонталниот трансфер на гени, блиску сродни бактерии можат да имаат многу различна [[Морфологија (биологија)|морфологија]] и типови на метаболизам. За да се надмине оваа несигурност, модерните бактериски класификации се засновани на [[молекуларна систематика]], за која се употребуваат генетски техники, како што се одредувањето на односот [[гванин]]:[[цитозин]], [[геном-геном хибридизација]], како и [[Секвенционирање|секвенционирање на гените]] кои не подлегнале на екстензивен хоризонтален трансфер на гени, како што е генот на [[Рибозомална РНК|рибозомалната РНК]].<ref>{{Наведено списание|last=Olsen|first=G. J.|last2=Woese|first2=C. R.|last3=Overbeek|first3=R. A.|date=1996-03-01|title=The Winds of (evolutionary) Change: Breathing New Life into Microbiology|url=https://www.osti.gov/scitech/biblio/205047-xNbftD/webviewable/|language=English}}</ref> Класификацијата на бактериите се официјализира со објавување во ''[[International Journal of Systematic Bacteriology]]'' и ''[[Bergey's Manual of Systematic Bacteriology]]''. ''[[International Committee on Systematic Bacteriology (ICSB)]]'' ги одржува интернационалните правила за именување на бактериите и таксономските категории и за нивно рангирање во ''[[International Code of Nomenclature of Bacteria]]''.

Идентификацијата на бактериите во лабораторија е од посебно значење за [[Медицина|медицината]] бидејќи одредувањето на точната терапија зависи од бактерискиот вид кој е причинител на [[Инфекција|инфекцијата]]. [[Боење според Грам|Боењето според Грам]], откриено во 1884 година од [[Ханс Кристијан Грам]], ги карактеризира бактериите според структурата на нивниот [[клеточен ѕид]]. Дебелите слоеви од [[пептидогликан]] кај [[Грампозитивни бактерии|Грам-позитивниот]] [[клеточен ѕид]] се обојуваат пурпурно, додека тенките слоеви од пептидогликан кај [[Грамнегативни бактерии|Грам-негативниот]] клеточен ѕид се обојуваат розево. Со комбинација на морфологијата и Грам обојувањето, повеќето бактерии може да се класифицираат во 4 групи: ''Грам-позитивни коки'', ''Грам-позитивни бацили'', ''Грам-негативни коки'' и ''Грам-негативни бацили''. Некои бактерии најдобро се идентификуваат со обојувања различни од она на Грам, особено [[Микобактерии|микобактериите]] и ''[[Nocardia]]'' кои се бојат по [[Ziehl–Neelsen]] или слични обојувања.<ref>{{Наведено списание|last=Woods|first=G L|last2=Walker|first2=D H|date=July 1996|title=Detection of infection or infectious agents by use of cytologic and histologic stains.|url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC172900/|journal=Clinical Microbiology Reviews|volume=9|issue=3|pages=382–404|issn=0893-8512|pmid=8809467}}</ref> Некои бактерии може да се идентификуваат само врз основа на нивниот раст во специјални медиуми или со употреба на техники како што е [[Серологија|серологијата]].

Техниките со култура се дизајнирани да го поттикнат растот на одредени бактерии додека се забавува растот на други бактерии во примерокот, што помага за идентификација. Често овие техники се дизајнирани за специфични примероци, како на пр. примерок од плунка ќе биде третиран за идентификација на причинителот на [[пневмонија]], додека примероци од [[измет]] се култивираат на селективни медиуми за да се идентифицира причинителот на [[дијареа]], додека во исто време се спречува растот на непатогени бактерии. Примероците кои треба да бидат [[Стерилно|стерилни]], како што се [[Крв|крвта]], [[ликвор]], [[урина]], се култивираат во посебни услови дизајнирани да се овозможи раст на сите можни [[Микроорганизам|микроорганизми]].<ref>{{Наведено списание|last=Weinstein|first=M. P.|date=March 1994|title=Clinical importance of blood cultures|url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/8181237|journal=Clinics in Laboratory Medicine|volume=14|issue=1|pages=9–16|issn=0272-2712|pmid=8181237}}</ref> Штом ќе се изолира патоген микроорганизам се пристапува кон негова идентификација врз основа на морфологијата, карактеристики во растот, обојубањеобојување, хемолитички особини итн.

Во идентификацијата на бактериите се почесто се користат молекуларните методи. Дијагностиката базирана на [[ДНК]] методи, како што е [[Полимераза верижна реакција|полимераза верижната реакција]] се се попопуларни како резултат на нивната специфичност и брзина.<ref>{{Наведено списание|last=Louie|first=Marie|last2=Louie|first2=Lisa|last3=Simor|first3=Andrew E.|date=2000-08-08|title=The role of DNA amplification technology in the diagnosis of infectious diseases|url=http://www.cmaj.ca/content/163/3/301|journal=Canadian Medical Association Journal|language=en|volume=163|issue=3|pages=301–309|issn=0820-3946|pmid=10951731}}</ref> Овие методи овозможуваат детекција и идентификација на виабилнивијабилни бактерии кои не може да се култивираат, кои се метаболно активни но не се делат.<ref>{{Наведено списание|last=Oliver|first=James D.|date=February 2005|title=The viable but nonculturable state in bacteria|url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/15765062|journal=Journal of Microbiology (Seoul, Korea)|volume=43 Spec No|pages=93–100|issn=1225-8873|pmid=15765062}}</ref> Меѓутоа, дури и со употреба на овие модерни методи, вкупниот број на бактериски видови е непознат и не може со сигурност да се одреди. Според денешните класификации има нешто помалку од 9300 познати видови на [[прокариоти]], вклучувајќи ги бактериите и археите,<ref>{{Наведена мрежна страница|url=https://web.archive.org/web/20120119210136/http://www.bacterio.cict.fr/number.html|title=Number of published names|date=2012-01-19|accessdate=2018-01-14}}</ref> но проценките за вистинскиот број на бактерискиот диверзитет се движи во рамките на 10⁷ - 10⁹ бактериски видови, иако постојат мислења дека и овие цифри го потценуваат вистинскиот диверзитет на бактерискиот свет.<ref>{{Наведено списание|last=Curtis|first=Thomas P.|last2=Sloan|first2=William T.|last3=Scannell|first3=Jack W.|date=2002-08-06|title=Estimating prokaryotic diversity and its limits|url=http://www.pnas.org/content/99/16/10494|journal=Proceedings of the National Academy of Sciences|language=en|volume=99|issue=16|pages=10494–10499|doi=10.1073/pnas.142680199|issn=0027-8424|pmid=12097644}}</ref><ref>{{Наведено списание|last=Schloss|first=Patrick D.|last2=Handelsman|first2=Jo|date=2004-12-01|title=Status of the Microbial Census|url=http://mmbr.asm.org/content/68/4/686|journal=Microbiology and Molecular Biology Reviews|language=en|volume=68|issue=4|pages=686–691|doi=10.1128/MMBR.68.4.686-691.2004|issn=1092-2172|pmid=15590780}}</ref>

= ВидиВидете исто така =